本所教學重點及特色如下：與花蓮慈濟醫學中心之輻射相關研究中心相結合，配合慈濟醫學中心貴重及特殊儀器，持續擴充現有研究空間與設備。未來研究發展重點為核醫藥物與影像、醫學物理、輻射生物等領域，本所與慈濟各醫院 (花蓮慈濟醫學中心、台北分院、台中分院、大林分院等)合作密切 ，共享人力與設備。

　　未來願景與目標：培育放射碩士級研究與管理人才、培育生命醫學與輻射生物研究人才、提昇東部放射相關醫療與研究水準，增進醫療品質與服務、整合慈濟相關醫學資源，成為具全國特色之放射醫學研究中心。